Shinn Asuka

Lồng tiếng bởi Suzumura Kenichi

Sinh ngày 1 tháng 9 C.E 57, nhóm máu O, Coordinator, thành viên đội hoa tiêu trên tàu Minerva của quân đội ZAFT. Ban đầu anh là "người hùng" của phim nhưng càng về sau nhân vật chuyển biến ngày càng phức tạp, và được nhìn nhận với cả hai khía cạnh: chính diện và phản diện - trong đó phần phản diện nhiều hơn. Sinh sống ở Orb, cha mẹ và em gái chết vì đạn lạc của Orb nên Shinn vô cùng căm ghét nơi này, căm ghét gia đình Athha.

Athrun Zala

Lồng tiếng bởi Ishida Akira

Vẫn giằng xé và bối rối nên anh quay trở lại hàng ngũ ZAFT để tìm cách ngăn cản chiến tranh. Tuy nhiên trong gần suốt cuộc chiến Athrun bị chủ tịch mới của PLANT là Gilbert Durandal lợi dụng. Sau đó anh đã nhận ra những gì phải làm và trở lại ORB. Athrun có thể coi là nhân vật anh hùng chính diện của Gundam Seed Destiny, đặc biệt do vai trò của anh trong việc chuyển biến tính cách của Shinn. shinn là con người rất dặt biệt

Kira Yamato

Lồng tiếng bởi Hoshi Soichiro

Người hùng của cuộc chiến trước (Gundam Seed). Anh trở lại, tham gia vào chiến trường một lần nữa. Kira đã trưởng thành, quyết đoán hơn nhiều so với 2 năm trước. Anh trở lại chiến trường với người máy ZGMX-X10A Freedom, sau này anh bị Shin đánh bại và mất chiếc Gundam Freedom trở lại với một Gundam mới, ZGMF-X20A Strike Freedom

Cagalli Yula Athha

Lồng tiếng bởi Shindou Naomi

Công chúa ORB Union, giờ đây tiếp bước cha nuôi, cô là người đứng đầu của Orb. Chỉ mới 18 tuổi nên Cagalli không được tin tưởng, bị người khác che mắt và có nhiều quyết định sai lầm. Tuy nhiên với sự giúp đỡ của bạn bè và những người trung thành, cô đã từng bước trưởng thành.

Lacus Clyne

Lồng tiếng bởi Tanaka Rie

Sau cuộc chiến trước, Lacus ở lại Orb cùng với Kira, Athrun và Cagalli. Ảnh hưởng của cô gái này đối với người dân PLANT quá lớn nên Gilbert Durandal dùng đủ mọi cách để triệt hạ cô.